В альпийской и лесной зонах Алматинского заповедника обитают волки, лисицы, дикие кабаны, барсуки, дикобразы, сурки, косули и моралы. Тянь-шанские медведи обитают в еловых лесах, но ближе к осени спускаются в луговую зону, где питаются яблоками. Всего в заповеднике насчитывается около 20 Самый редкий представитель фауны природоохранной зоны — снежный барс. Эти млекопитающие семейства кошачьих отличаются окрасом удивительной красоты. Обитают они в горной местности, их белая шуба служит маскировкой на заснеженных склонах. Зимой ирбисы спускаются в горные долины, где охотятся на горных козлов. Точное количество особей в заповеднике неизвестно из их скрытности
