В толковом словаре Даля есть и бобёр (муж.р.), и бобриха(жен.р) )))
Оба этих слова имеют право на их употребление и в настоящее время, но исключительно в качестве просторечия...
С точки же зрения зоологии, правильным будет говорить и писать - бобр!
К примеру, по отдельным падежам:
Кто? Бобр, бобры
Кого? Бобра, бобров
Кому? Бобру, бобрам
Кем? Бобром, бобрами
О ком? О бобре, о бобрах
