Здесь два вводных слова стоят рядом, поэтому правильные знаки препинания такие:
Во-вторых, может быть, этой книге сто лет (две запятые).
Если бы МОЖЕТ БЫТЬ было не вводным, тогда порядок слов в предложении был бы такой:
Во-вторых, этой книге может быть более ста лет.
