1. Как раз в это время Винтик и Шпунтик увидели стоявший посреди дороги автомобиль×.
Определение, выраженное причастным оборотом, стоящим перед определяемым словом×, не обособляется (без особых причин).
2. Из карманов их курток вечно торчали гаечные ключи, клещи, напильники и другие железные инструменты.
Запятые между однородными членами предложения.
3. Тут были яркая гвоздика и красные (~~~), оранжевые (~~~) и жёлтые (~~~) лилии.
Запятая ставится лишь между однородными определениями, так как союзы "и" соединяют различные группы однородных членов
4. Солнышко нас и накормит, и напоит, и обогреет, и высушит.
Запятая ставится между однородными членами, связанными повторяющимся союзом "и".
5. Он с наслаждением глядел на прозрачное небо (---), на свежую зелень (---).
Запятая ставится между однородными членами предложения.