1) Вода отражала небо и была то серой, то бирюзовой, то мягко-молочного цвета.
2) С запада надвигалась туча, заволокла все небо, и начался дождь.
3) Перед ним пестрели и цвели луга и нивы золотые. не нужна запятая, т.к. однородные подлежащие луга и нивы.