Предложение: я понимаю, что с вами. неполное вроде как. вопрос: вторую часть считать придаточным предложением или это вообще не предложение, если должно быть сказуемое, но оно опущено. запуталась я.

Я понимаю, что с вами.

понимаю (что?), что с вами — изъяснительное придаточное.

[ – = ], (что --- ).

Придаточное, действительно, неполное: по смыслу там пропущено сказуемое наподобие «случилось/произошло», т.е. «что случилось с вами».