В обоих случаях будет е, так как в обоих случаях "в течение" - это предог.
То, что это предлог, можно понять по смыслу. "В течение" = в течение времени.
Е,Производный предлог «в течение» (года, месяца, недели, часа) пишется с окончанием -е. Существительное в форме предложного падежа «в течении» (реки) пишется с окончанием -и.