В данном случае правильно :Курсы которые стоят больших денег
Курсы, которые стоят больших денег.
Объяснение:
Курсы, которые стоят (чего?) больших денег (родительный падеж)
"Курсы, которые стоят большие деньги" - неверно, так как используется именительный падеж
