- Озеро Чебачье 1
- Озеро Чебачье 2
- Озеро Большой Бугодак
- Низовье реки Малый Кизил
- Верхнеуральский родник
- Озеро Большой Биляшкуль
- Аргазинское водохранилище
- Озеро Сугомак
- Река Большой Киалим
- Озеро Уфимское
- Озеро Серебры
- Миньярский пруд
- Ключ Ералашный
- Ключ Ериклинский
- Симский пруд
- Река Аша
- Провальный ключ
- Река Юрюзань от Смирновского моста до устья реки Наси
- Река Тюлюк
- Шумный брод в долине реки Тогузак
- Белый Камень в долине реки Тогузак
- Озеро Горькое-Соленое
- Озеро Карачура
- Озеро Иткуль
- Участок реки Уфа между Тимофеевым и Зайкиным камнями
- Уфимский целебный источник
- Озеро Светленькое
- Озеро Долгое
- Озеро Аракуль
- Озеро Чебакуль
- Участок реки Караболки от села Усть-Караболка до устья
- Участок реки Багаряк от базы отдыха "Березка" до устья
- Клюквенное болото
- Озеро Сугояк
- Озеро Соленый Кулат
- Озеро Смолино
- Озеро Большой Шантропай
- Озеро Горькое (Еткульский район)
- Река Ай от устья реки Бейды до деревни Сикияз-Тамак
- Озеро Горькое (Увельский район)
- Озеро Подборное
- Озеро Пахомово
- Озеро Малый Еланчик
- Озеро Кошкуль
- Озеро Тургояк
- Река Куштумга
- Река Атлян
- Озеро Большой Еланчик
- Озеро Песочное
- Озеро Увильды
