площадь озера 260 км², в том числе около 38 км² приходится на острова (их на селигере более 160). крупнейший — хачин.
площадь всего бассейна — 2275 км².
селигер принимает 110 притоков (наиболее крупные — реки крапивенка, сорога и серемуха ( а из него вытекает лишь одна река селижаровка. озеро лежит на высоте 205 метров над уровнем моря и имеет ледниковое происхождение. этим объясняется его своеобразная форма — это не озеро в привычном понятии, а скорее цепочка озёр, протянувшихся с севера на юг на 100 км и связанных между собой короткими узкими протоками. береговая линия протяжённостью более 500 км отличается изрезанностью — поросшие лесом мысы, глубокие вдавшиеся в сушу живописные заливы, разнообразные по форме острова.
озеро селигер, нило-столобенская пустыньна селигере насчитывается 24 плёса, самые большие — полновский, осташковский, кравотынский, селижаровский, троицкий, сосницкий, нижнекотицкий и березовский. отдельные части озера носят самостоятельные названия: озёра вясцо, величко, серемо, глубокое, долгое, святое, сватица и другие.
вода в селигере прозрачная, прозрачность достигает 5 метров.
на берегу южной части озера селигер расположены город осташков и усадьба «новые ельцы».
