В тяжёлые для страны годы Великой Отечественной войны произошло заметное изменение политики советского государства в отношении Русской Православной церкви, которой было отдано однозначное предпочтение перед обновленческими структурами, признанными с 1922 года государственными органами как «Православная Российская Церковь», которые полностью исчезли уже в 1946 году. Московская Патриархия была признана как единственная законная православная церковь в СССР (без Грузии) всеми прочими поместными православными церквами. 8 сентября 1943 года Собор епископов избрал митрополита Сергия (Страгородского) на Патриарший престол. Было открыто несколько богословских школ (впоследствии получивших статус семинарий и академий). Тысячи храмов, открытых на территории, занятой германской армией, продолжили деятельность после её освобождения советскими войсками. С 1947 года, однако, началось некоторое ужесточение антирелигиозной политики на идеологическом и пропагандистском уровне, которое распространялось также и на РПЦ.
