Следователи руководствовались прямыми указаниями и наставлениями императрицы, которая направляла дознание к выяснению причин восстания, выявлению его “подстрекателей” (предполагая в числе таковых и раскольников-старообрядцев, и иностранную агентуру, и даже оппозиционно настроенных деятелей из верхов российского дворянства) и, наконец, к установлению обстоятельств происхождения самозванства Пугачева, принявшего на себя титул и имя “императора Петра Третьего”. Эти указания Екатерины II определили направление действий следственных комиссий в дознании над Пугачевым и прямым образом сказались на содержании протоколов его показаний, где преобладает материал, отображающий предысторию Крестьянской войны. Доказательствами были показания Пугачева и его соратников, полученные во время следствия. По законодательству 18 века Пугачев вор. Термин «вор» в русском языке до XVIII века означал преступника, злодея, обманщика (осуществляющий кражу назывался «тать»).
