Гипотеза фагоцителлы была предложена Ильёй Ильичём Мечниковым в 1882 году. Согласно этой гипотезе, многоклеточные произошли от колониальных простейших - жгутиковых. Происходит иммиграция клеток внутрь и образуются ранние фагоцителлы - без рта (трихоплаксы). В дальнейшем у них формируется рот (кишечнополостные).
Наружный слой фагоцителл - жгутиковые клетки (функция движения и защиты). Внутренний - клетки-амебы (переваривание пищи).
