Кристаллическая решётка оксида углерода и диоксида кремния состоит из молекул неметаллов. почему в одном случае кристаллическая решётка молекулярная,а в другом-атомная?

Потому что в случае с CO2 в узлах решетки находятся молекулы (поэтому молекулярная) углекислого газа, а в случае с SiO2 – в узлах решетки отдельно находятся атомы (поэтому атомная) кремния и кислорода.