Патриарх Филарет - в миру Фёдор Романов, был знатным боярином, родственником одной из жён Ивана Грозного. Был одним из претендентов на престол, чтобы положить конец его претензиям, его постригли в монахи, после чего он стал делать карьеру в церкви. В конце концов все же принял деятельное участие в управлении Россией через своего сына Михаила Романова, который всё же стал царем.
Он занял наивысшую ступень церковной иерархии, и это позволило ему обладать достаточным влиянием, чтобы продвинуть своего сына на престол. После этого он долгое время пробыл важнейшим его советником и соправителем, и сделал многое для укрепления России после Смутного времени.
Главным поводом для начала военных действий послужило то, что Ливонский орден не уплатил дань, которую оно должно было уплачивать по мирному договору пятьдесят четвёртого года. Русское войско вторглось в Ливонию в 1558 году. В первое время (1558-1561 гг.) были взяты несколько замков и городов (Юрьев, Нарва, Дерпт).
Однако вместо продолжения успешного наступления московское правительство предоставляет ордену перемирие, одновременно с этим снарядив военную экспедицию против Крыма. Ливонские рыцари, воспользовавшись поддержкой собрали силы и нанесли поражение московским войскам за месяц до окончания перемирия.
Против Крыма Россия не добилась положительного результата от военных действий. Также был упущен благоприятный момент для победы в Ливонии. Магистр Кетлер в 1561 году подписывает договор, согласно которому орден переходит под протекторат Польши и Литвы.
После заключения мира с Крымским ханством Москва сосредоточила силы на Ливонии, однако теперь вместо слабого ордена приходилось столкнуться сразу с несколькими мощными претендентами. И если в первое время удалось избежать войны с Данией и Швецией, то война с Польско-литовским королём была неизбежной.
Самым большим достижением российский войск во втором этапе Ливонской войны было взятие Полоцка в 1563 году, после чего было множество бесплодных переговоров и неудачных битв, в результате которых даже крымский хан решил отказаться от союза с московской властью.