В одном из сражений с джунгарами в 1635 году Жангир попал в плен. После заключения мирного договора был отпущен на родину с обязательством больше не беспокоить границы Джунгарского ханства. Пленение подорвали на некоторое время его авторитет среди политических соперников и населения.
Как указывают многие исторические документы, Жангир поддерживал дипломатические и союзнические отношения с Кашгарским ханством, что стало продолжением политических традиций, заложенных его отцом. Сын Жангир-хана Аппак-султан между 1638–1652 гг, то есть при жизни отца, ходил послом к могольскому хану Абдаллаху.
