Город-крепость получил название « Крепость Панахабад » в честь Панах Али Хана, который был основателем крепости.
Город вначале назывался Панахабад в честь своего основателя, а позднее стал называться Шуша по имени близлежащего селения Шушикент, часть жителей которого была переселена в новый город, вместе с жителями Шах-булага и нескольких других деревень.
