Озеро Шарташ образовалось около 1 миллиона лет назад. Формой озеро напоминает боб, и форма озера практически не менялась на протяжении всех лет существования. Лишь на берегах его менялась флора и фауна, гигантские папоротники сменялись хвойными и цветковыми растениями, а ящеры разных видов уступили место на лесистых берегах озера медведям, лосям, волкам. Есть мнение, что менялась не только растительность и животный мир. В озере бьёт около 50 маленьких ключей, преимущественно с ледяной водой, что не даёт озеру высохнуть.
