В бассейне Немана имеется множество мелких озёр, озёрность достигает 2,5 %. Питание смешанное с преобладанием снегового, в низовьях — дождевого. Среднегодовой расход воды — 678 м³/с. Весеннее половодье с середины марта до конца мая; летом межень, прерываемая дождевыми паводками, более характерными для осени и зимы.
Питание реки смешанное, преобладает снеговое, в нижнем течении дождевое. Весеннее половодье наблюдается с середины марта до конца мая. Летняя межень сменяется дождевыми паводками, которые характерны для осенне-зимнего времени. В устьевой зоне немалую роль во время межени играют ветровые нагоны и сгоны воды.
