Животные пустынь и полупустынь бедны как по видовому составу, так и по численности, что объясняется скудностью условий существования и незначительной их площадью. В Кыргызстане в эту природную зону проникает местами лишь один вид земноводных - зеленая жаба. В то же время здесь обитает наибольшее число видов пресмыкающихся, встречающихся в республике. Среди них среднеазиатская черепаха, серый геккон, пустынный гологлаз, серый варан, киргизская ящурка, восточный удавчик, стрела-змея, щитомордник.
