Плохое, так как постоянно происходит сброс промышленных, сельскохозяйственных и бытовых отходов особенно в её северной части, у берегов Бурунди.По причине отсутствия водопровода и канализации жители прибрежных деревень нередко справляют естественные нужды прямо в озеро, при этом воду для бытовых нужд они берут из этого же водоёма. Как следствие, в Бурунди регулярно отмечаются вспышки инфекционных заболеваний, прежде всего холеры.Еще одна проблема заключается в том что в последнее время стало распространение в озере новых видов растений.Из них наибольшую опасность, по мнению учёных, представляет водяной гиацинт . Разрастаясь с большой скоростью, это растение покрывает поверхность озера плотным ковром, что препятствует доступу солнечного света, а также нарушает естественный кислородный режим водоёма. Это приводит к миграции или гибели обитающих в озере организмов. Кроме того, создаются препятствия для судоходства.
