На пер­вом этапе со­зда­ния ге­те­ро­зис­но­го сорта рас­те­ния необходимо

провести мно­го­крат­ное са­мо­опы­ле­ние ис­ход­ных форм и по­лу­чить ин­бред­ные линии
Несмотря на неблагоприятные последствия самоопыления, его часто применяют у перекрестноопыляемых растений для получения гомозиготных («чистых») линий с нужными признаками. Это приводит к снижению урожайности. Однако затем проводят перекрестное опыление между разными самоопыляющимися линиями и в результате в ряде случаев получают высокоурожайные гибриды, обладающие нужными селекционеру свойствами. Это метод межлинейной гибридизации, при котором часто наблюдается эффект гетерозиса: гибриды первого поколения обладают высокой урожайностью и устойчивостью к неблагоприятным воздействиям.