Эктодерма является одним из трех первичных зародышевых слоев в самом раннем эмбрионе. Двумя другими слоями являются мезодерма (средний слой) и энтодерма (наиболее проксимальный слой), причем эктодерма является наиболее внешним (или дистальным) слоем.
Энтодерма - один из зародышевых листков, формируется в процессе эмбриогенеза. Формирования энтодермы проходит после впячивания стенки бластулы в процессе гаструляции, при формировании первичной кишки (архентерон).