Археї генетично відмінні від еукаріот і бактерій, причому до 15 % білків, що кодуються одним геном бактерії, є унікальними для цього домену, хоча функції багатьох цих білків невідомі. Більша частина унікальних білків, функція яких відома, належить евріархеотам і задіяна в метаногенезі.
