Нематоды – раздельнополые животные. Органы размножения имеют трубчатое строение. Мужская половая система включает в себя один семенник, один семяпровод, один семяизвергательный канал, открывающийся в конечный отдел кишечника – клоаку. У большинства видов имеются совокупительные органы – спикулы и рулек.
