Различают три стадии в механизме ферментативного катализа:
образование фермент-субстратного комплекса;
образование комплекса «фермент-продукт реакции»;
отщепление продуктов реакции от фермента.
Первая стадия фермент отличается от белка наличием АЦ — участка, с которого фермент соединяется с субстратом и ускоряет реакцию. Долгое время считали, что между ферментом и субстратом имеется точное соответствие («ключ к замку»). Однако сейчас принято считать, что АЦ фермента при к субстрату в ходе реакции (теория вынужденного соответствия). В АЦ имеются якорные участки, за счет которых субстрат закрепляется. Каталитический участок АЦ ответственен за тип ускоряемой реакции
Вторая стадия – функционально-активные группы АЦ фермента действуют на субстрат, дестабилизируя связи в нем, вызывая изменение конфигурации субстрата, поляризацию его молекулы, растяжение связей и т.д. Это приводит к химическому преобразованию субстрата (т.е. к протеканию реакции) и образованию продуктов реакции, которые некоторое время находятся в связи с ферментом
Третья стадия – от нее зависит скорость реакции. Происходит отделение фермента от продуктов реакции.
