1) Палеонтологические доказательства эволюции животных кроются в разнообразных находках учёных, занимающихся изучением разнообразных ископаемых останков и древних пород. Например, используя в качестве прикладного материала ископаемые останки разнообразных древних животных и применяя к ним различные радионуклидные методы анализа мы можем поэтапно проследить изменения в строении той или иной группы животных и выявить постепенность изменений в строении их организмов под воздействием изменяющихся условий окружающей среды.
2) Эмбриологические доказательства эволюции кроются в том факте, что в процессе эмбриогенеза каждый из организмов постепенно проходит в своем развитии все этапы эволюционного становления вида, к которому принадлежит, начиная от самых древних предковых форм. Например, на определённом этапе развития эмбриона человека учёные могут проследить в его строении наличие жаберных щелей, перепонок между пальцами и хвоста.
3) Сравнительно анатомические доказательства эволюции заключаются в том, что при сравнении организмов близкородственных видов, мы можем увидеть некоторые различия в их строении (порой даже очень существенные), которые обусловлены различными воздействиями различающихся факторов окружающей среды. Иногда различия выявляются также и в пределах одного вида, но практически никогда в пределах одной популяции.
