Під водою організм насамперед підтримує функціонування мозку. При відтокові крові з рук і ніг, погіршується моторика. Є ризик втрати свідомості через гіпоксію.
Також мозок відіграє важливу роль в психологічних аспектах занурення. Фрідайвінг – заняття небезпечне, тому фактор страху завжди присутній. Новачків лякає темрява, незрозумілі звуки та неможливість вдихнути. Атлетові потрібно впоратися зі своїми страхами, сконцентрувавшись на зануренні.