Прокариоты осуществляют фотосинтез, тем самым продуцируя в атмосферу кислород. Среди прокариот значительно распространен хемосинтез. Кроме того, среди бактериальных организмов имеются азотофиксирующие формы: это единственная на нашей планете группа живых организмов, которые усваивать азот непосредственно из атмосферного воздуха и таким образом вовлекать молекулярный азот в биологический цикл.
Также прокариоты имеют и другую важнейшую функцию: возвращение неорганических веществ в окружающую среду путем разрушения (минерализации) органических соединений.
На уровне биосферы в целом прокариоты, в первую очередь бактерии, обладают еще одной очень важной функцией - концентрационной. Они активно извлекать из окружающей среды определенные элементы даже при крайне низких их концентрациях.
Свойства и функции прокариот настолько разнообразны, что в принципе они создавать устойчиво функционирующие свойственные (т. е. только при своем участии) экосистемы
