come on будет, если читать это предложение как "Давай быстрее, или мы сейчас опоздаем"
come in будет, если перевести как "Заходите скорее, или мы опоздаем (например, на лекцию)".
лично я склоняюсь к первому.
смотрите, какой вариант больше подходит по смыслу.
